Οι επιτυχίες που έχει να αναδείξει; Πολλές! Συγκεκριμένα:
Τη σεζόν 2002-2003 ο Ολυμπιακός πετυχαίνει την μεγαλύτερη νίκη στην ιστορία του στο Champions League καθώς η ομάδα του Λεμονή επικρατεί με 6-2 της finalist της προηγούμενης σεζόν του Champions League, της Μπάγερ Λεβερκούζεν!
Τη σεζόν 2007-2008 είναι μια σεζόν που αν μη τι άλλο το όνομα του Λεμονή γίνεται συνώνυμο με τις επιτυχίες και η ομάδα παίζει εκπληκτικό ποδόσφαιρο και προκρίνεται στους 16! Καταφέρνει μάλιστα ο Λεμονής να γράψει ιστορία ως ο προπονητής που έφερε το πρώτο διπλο και μάλιστα μέσα στην έδρα της Βέρντερ με 1-3!
Μάλιστα λίγες εβδομάδες μετά ο Λεμονής και η παρέα τουτο επαναλαμβάνουν μέσα στην Ρώμη με αντίπαλο την Λάτσιο και επικρατούν με 1-2.
Για να έρθει το κερασάκι στην τούρτα και να επικρατήσουν της Βέρνερ με μια εμφατική νίκη με 3-0 μέσα στο Καραϊσκάκης και να πάρουν το εισιτήριο για την επομένη φάση!